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Twist Bioscience 推出 FlexPrep? 超高通量文庫制備試劑盒,適用于農(nóng)業(yè)基因組學(xué)和群體基因組學(xué)應(yīng)用
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時間: 2024-11-13 | 454 次瀏覽 | 分享到:

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Twist Bioscience公司推出的FlexPrep? 超高通量文庫制備試劑盒,通過引入新穎的 Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù),改進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)酶促片段化文庫制備方法,以低成本實現(xiàn)高通量,旨在加速芯片用戶在群體基因組學(xué)和農(nóng)業(yè)基因組學(xué)領(lǐng)域的NGS研究。

Twist FlexPrep? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒

Twist FlexPrep ? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒的工作流程旨在為簡化和大規(guī)模擴(kuò)展 Twist 已建立的酶切方法而設(shè)計。Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù)消除了在文庫制備前對每個DNA樣本進(jìn)行定量和對大量人工耗費的需要,從而大大節(jié)省了每個樣本的成本。在多孔板中對每個樣本進(jìn)行片段化和接頭連接后,*多可以將12個樣本合并到一個管中,顯著減少后續(xù)磁珠純化和擴(kuò)增步驟所需的試劑用量和成本??衫么嗽噭┖兄苽涞奈膸?,使用靶向富集組合進(jìn)行全基因組或靶向測序。所有多孔板和管式都經(jīng)過優(yōu)化,以確保與關(guān)鍵自動化系統(tǒng)兼容,這對于希望簡化工作流程并減少動手時間的實驗室來說是一個關(guān)鍵考慮因素。

關(guān)鍵優(yōu)勢

集成的NBL技術(shù)

? 消除前期歸一化處理

? 無需中間定量

? 樣品起始量區(qū)間寬泛(30ng-300ng)

早期混樣節(jié)省成本

? 接頭連接反應(yīng)之后將96個樣本合并到8管中

? 降低上游反應(yīng)體積

? 減少下游反應(yīng)耗材

專為超高容量多重測序而生

? 單個試劑盒多達(dá)1152個UDIs

? 反應(yīng)數(shù)量擴(kuò)大12倍

? 每個靶向富集反應(yīng)可支持96個樣本

數(shù)據(jù)展示

消除前期歸一化和中間定量樣品

Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒采用新穎的 Normalization by Ligation(NBL)技術(shù),消除了前期和中間樣品定量的需要,簡化了測序工作流程(圖1)。

專為節(jié)省成本且不影響質(zhì)量而構(gòu)建的工作流程

FlexPrep標(biāo)準(zhǔn)化接頭包含12個內(nèi)聯(lián)條形碼,它允許超高通量和自動化友好的多重測序策略(圖2)。

Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒,通過在一個試劑盒的單次測序中運行多達(dá)1152個樣本來實現(xiàn)測序通量*大化,這種提高效率的策略可以轉(zhuǎn)化為節(jié)省試劑、耗材和時間成本。與單獨處理樣本相比,F(xiàn)lexPrep?將使用的耗材減少了12倍,并將移液器吸頭的數(shù)量從標(biāo)準(zhǔn)試劑盒中使用的17,000多個減少到FlexPrep? UHT試劑盒中使用的不到4,000個。

Twist FlexPrep UHT產(chǎn)量均一,且插入片段尺寸穩(wěn)定

Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit支持30 ng至300 ng的起始量范圍,對全基因組測序(WGS)或靶向富集(TE)的均勻性和插入片段尺寸的影響*?。ㄈ鐖D3和圖4)。

通過靶向富集確定感興趣區(qū)域

FlexPrep的工作流程也可以擴(kuò)展到靶向富集,其中單個富集反應(yīng)可用于多達(dá)96個樣品。

與其他Twist文庫制備試劑盒一樣,F(xiàn)lexPrep UHT生成的高復(fù)雜性文庫在靶向富集后具有均勻的覆蓋率(表1)。結(jié)合Twsit定制Panel,以實現(xiàn)對感興趣的基因組區(qū)域的可調(diào)控且均勻的覆蓋。


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